安全性能对于全钢通风柜来说，它是很需要保障的一点属性，因为原本就应用于安全领域的全钢通风柜如果出现安全事故那么对实验和科研人员造成的损害是不堪设想的。在很多意外状况下，都是因为它出现故障或者临时崩坏导致实验室被损毁或者造成了人员受伤的情况。所以此设备的安全性能是需要着重考虑的设计要素。
在安全性能设计上，除了定期替换全钢通风柜内部的净化物质和定期清洁管道内的淤积物之外，外形和内部的设计也需要斟酌考虑，才能够让通风柜的设计越为科学合理，要考虑到的要素有如下几点：设备的排风装置应该使用狭缝式排风装置，保障排出的有害气体不会影响到正在进行试验的科研人员并且准确经过通风排放净化管道，让它的净化效果到了良佳。